1. Šlo, ale lepší řešení je mít OS na jednom disku (systémovém) a zálohy data cokoliv na druhém, kromě toho Ubuntu se bude chovat jak šnek. když se bude spouštět s HDD oproti Windows na SSD. Za další budeš řešit ,aby HDD byl v boot order v BIOSU nastaven jako první v pořadí, protože budeš muset využít GRUB u Linuxu, aby ti bootovaly oba systémy, zase z toho plyne zbytečná komplikace, leda by sis GRUB nainstaloval na to SSD.
2.Lze, ale po restartování se ti samozřejmě smaže, protože se jedná o live verzi Ubuntu. Mohl by sis vytvořit persitence usb flashdisk, a nainstalovat si flash na druhý oddíl, ovšem je otázka jak by to doopravdy fungovalo.