Já bych doporučil čistou instalaci, přece jen na HDD jsi fungoval jinak!
Pak viz výše AcronisTrueImage i ostatní podobné produkty umí v programu vytvořit boot CD laskavě si to tam najdi. Nápověda:
http://abload.de/img/snap7648uju0h.png
a z něj pak nabootuj a děláš co potřebuješ, klonování, zálohování, obnovy záloh. Pochopitelně u záloh musíš mít data na jiném než boot disku třeba ext. HDD co já vím. Instalovaný program v OS nikdy není tak spolehlivý jako práce mimo aktivní OS.