Běž do složky
~/.config/autostart
V ní vyhledej příslušný soubor .desktop který spouští ten tvůj skript.
Otevři ho v txt editoru (gedit).
Najdi řádek
Terminal=false
A změň ho na
Terminal=true
Pokud tam ten řádek není, dopiš ho tam
Nakonec dej uložit.
Na poslední řádek toho tvého skriptu dopiš
exec $SHELL
Jinak by se po provedení příkazu Terminál ihned zavřel a ty by sis nestihl přečíst co se v něm vypsalo. Pokud ta úloha v (Terminálu) běží stále, psát to tam nemusíš.