Tak to máš blbý. Asi při instalaci systému nebyla dodržena zásada, že nesmí být připojen žádný jiný disk než ten, na který se systém bude instalovat. Vypadá to, že byl při instalaci připojen i ten druhý disk a systém si i na něm vytvořil svůj skrytý oddíl.Asi bych to zkusil tak, že bych odpojil ten druhý disk a pokud by systém správně najížděl, prohlásil bych systémová data na odpojeném disku za nepotřebná. Pak bych po novém připojení na externí úložiště (třeba USB disk) zazálohoval veškerá uživatelská data na disku a následně na něm zrušil všechny oddíly. Nově bych jej potom naformátoval jako jeden svazek a data ze zálohy obnovil.