V tomto případě se nedá mluvit o "reinstalaci", ale o opravě.
Windows ti při nabootování nabídne možnost opravit stávající instalaci. Pak se pouze vyhledají chyby a případně opraví. Ale pouze chyby, o kterých systém ví, knihovny, které zná. Neopraví ti to chyby, které způsobuje software, který sis tam doinstaloval ani malware, který sis tam dotáhnul.