Jeden problém by ovšem nastat mohl. U některých základních desek s více PCI-E 16x sloty nastavuje, kolik mají aktivních linek (pro2 sloty je to pak buď 8+8 nebo 16+0). V tom druhém případě pak jeden z dvojice slotů nemá přidělenou žádnou datovou linku a tím pádem v něm při této konfiguraci žádná přídavná karta nebude fungovat.