Já ho nepoužívám, najdi si to v nastavení, když ho znáš, co je na tom, změnit kodek, kontejner, nastavit a spustit. Jinak výhoda Avidemuxu je, že se nemusí ani instalovat, stačí rozbalit. Některé apky dokonce podporují kódování pomocí GPU (CUDA) nebo CPU (iCore rodina) což je velice rychlá věc.
http://www.abload.de/img/snap6461rjjnm.png