AVI a MKV sú len kontajnery ktoré obsahujú multimediálne dáta. Ak má byť konverziou myslené len vyextrahovanie dát z kontajnera a zápis do iného kontajneru, tak to bude trvať rádovo minúty (kôli výkonu disku).
Otázkou je načo vôbec vykonávať konverziu. Matroska sa používa tam, kde AVI nemá šancu, napríklad ak má byť uchovaný film s viacerými jazykovými mutáciami.
PS.: odporúčam vyskúšať nejaký normálny prehrávač, napríklad VLC.