» Poradna » Hardware

Konfigurace PC pro molekulove modelovani

 |   | 

 Vazeni, ackoliv se v praci zabyvam necim jinym nez navrhovanim konfirgurace kompu, byl mi tento ukol sveren jako nekomu, kdo do IT (resp. HW) dela (coz je fakt). Presto bych se rad s vami poradil jaka konfigurace by byla nejvhodnejsi. Pocitac nebudu stavet ja, ale bude na zakazku sestaven firmou HP, s kterou ma nase společnost smlouvu (bohuzel). Jak je naspano v titulku, mělo by se jednat o PC pouze na molekulove modelovani. Pocitac bude maximalne vytizen, neboť jeden vypocet muze trvat několik dni, v extremnich pripadech i tydnu. Na jednom pocitaci by mělo bezet několik vypoctu paralelne. Stroj se tedy nebude prakticky vypinat !! Z toho duvodu je třeba vybrat zcela spolehlivou platformu. Sam sem priznivcem AMD, ale v tomto pripade jednoznacne preferuji Intel !! O CPU mam urcitou predstavu – mělo by se jednat o P4 pravdepodobne s jadrem Northwood a taktem v kazdem pripade nad 2GHz. Co se tyce MB, zde mam lehci okno, orientuji se prevazne v MB pro AMD – to necham na vas. Samozrejme preferuji ASUS, MSI prip. ABIT. Je jasne, ze nikdo pocitac nebude pretaktovavat, proto me ani nezajimaji ficurky BIOSu jako spis spolehlivost a stabilita. V kazdem pripade je nutne, aby MB obashoval integrovanou zvukovku ! Co se tyce graficke karty, zde si take nejsem moc jisty – vzhledem k faktu, ze vetsina softu na MM nevyuziva 3D akceleraci, ale v jakemsi pseudo3D pracuji (resp. 2D), uvazoval sem o necem od Matroxu – doporucte konkretni model. HDD – v tom mam jasno, 80GB Maxtor. Další veci je vypalovacka – necham si poradit, zde nejsou nijak vysoke naroky. S Cdckem si hlavu nelamu, v kazdem pripade tam neco bude. Pamet neresim – 512MB SDRAM (!) by melo stacit. Monitor vybrat nemuzu, spolecnost HP standartne k nam dodava monitory Philips (rovnez bohuzel), muzu nadiktovat pouze velikost, rozhodl sem se pro 19“.Cim vice prispevku bude, tim vice mi pomuzete ve vyberu. Akce to neni narazova – pocitac Ukázat celý příspěvek

Odpovědi na otázku

 |   | 

Oprava ohledne pameti - samozrejme pocitam s DDR   

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Tak na takovou vec bych imho nevolil vubec hw platformu PC. Jedine snad pokud je software co potrebujes, vyvijen na teto platforme (PC), ale to se mi nechce ani verit, i kdyz v tomto State je vsechno mozny.

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Zdravim, tohle by mne celkem zajimalo, protoze se v takovych vecech nepohybuju, jake platformy se tedy pro tyto ucely pouzivaji ? Mac nebo neco jineho ??Dik za odpoved, t2k

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

tipnul bych si na masinky od SGI a zacinal bych nekde u Octane, nejhur u O2.. ovsem podle vseho vynikajici pracovni stanice jsou i jejich masiny postavene na bazi i386 a bezici, povazte, na windows.. .

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Pro paralelni vypocty je lepsi AMD athlon,protoze ma podstatne kratsi pipelane. to je take duvod,proc se do serveru stale davaji PIII

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Vážený pane,Velni záleží na vlastnostech vaší aplikace, jestliže bude schopná podporovat víceprocosorový režim, lze navrhnout 2xPIIEB 1,4GhzPokud jednoprocesor tak zřejmě skutečně P4 na RIMM. kolem 2,5GhzDál bych Vás chtěl upozornit, že pokud máte smlouvu s některou firmou, dá se tato sestava nakoupit jako např,  systém pro zpracování XXX XXXX a jste ze smlouvy venku, nebo trvat na tom co skutečně potřebujete tak dlouho až ( v případě HP je to velmi pravděpodobné ) daná firma řekne, že to zajistit neumí. Protože se zabývám právě návrhem počítačů pro zpecifická určení,  můžete se na mě v případě zájmu obrátit pro konkrétní návrh sestavy. Ať již hodláte nakupovat u kohokoli.

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

No myslí si, že platforma IBM PC comp není na molekulove modelovani vhodná, ale lepší by byl Sun Sparc, Mac....Pokud trváte na PC tak bych volil dual PIII nebo dual Xeon4. Sestava bude velmi podobná stanicím pro CAD,CAM...atdS kartou Matrox  bych souhlasil, ale myslím, že v lepší sestavě by neměl být disk Maxtor, ale WD, Seagate nebo IBM.Pak než 1x19" monitor bych volil 2x18,5" LCDPocitac nebudu stavet ja, ale bude na zakazku sestaven firmou HP, s kterou ma nase společnost smlouvu (bohuzel).   ...No potěš. Tak na to že si bude moci vybrat desku od MSI nebo Asus hned zapomeňte. Firma HP ( a i jiné) mají své dodavatele a desky jsou pro HP přímo dělány( tedy většinou).  

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

No.. pokud me pamet nemyli, tak HP sveho casu vyrabel specialni radu PC, urcenou prave pro podobne "vymyslenosti".. v jejich podani se to jmenovalo pracovni stanice HP Kayak, stalo to neuveritelny prachy, ale rozhodne to taky patrilo mezi nejvyvazenejsi a nejvykonnejsi pocitace na platforme i386.. takze bych vubec nespekuloval tady, ale obratil se primo na HP s dotazem na pocitace tridy pracovnich stanic.. tyto konfigurace byly planovany a staveny pro maximalni vykon at uz vypocetnich nebo i grafickych aplikaci na bazi PC a povetsinou se jednalo o multiprocesorove stroje.. to uz jen tak na okraj...

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Pokud už si nechcete koupit pracovní stanici, tak...Já bych k tomu přidal ještě pořádnou UPSku na zálohování napájení s administrací. Je docela k vsteku přijít o několika hodinový výpočet.A paměti bych tam dal 1GB, případně namíru, aby se nemuselo moc swapovat.Předpokládám OS UNIX, takže bych ještě dodal druhý hardisk.Nejlépe Baracuda IV na data a WD s 8MB cache na swapovací oddíl. (WD jsou rychlé, ale mám velmi špatné zkušenosti s jejich spolehlivostí).Co se grafiky tíče, tak levné a dobré řešení je Hercules Prophet 4500 - Kyro II. Moc netopí, kvalitní obraz, slušné ovladače.No a AMD procesorům bych se nevyhýbal. Dvouprocesorové řešení s AMD nabízí lepší výkon za menší cenu. Byl jsem na jedné počítačové farmě - superpočítač tvořený sesíťováním většího množství PC s Durony.Do minulého měsíce tam byly D600MHz, poslední rok i přetaktované a jediné na co technik ukrutně nadával byly desky od MSI.

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Zdravim,dekuji za vsechny odpovedi. V techto chvilich zacine byt opet problematika aktualni. Co se ceny tyce nezmenilo se nic (80000,-). Vase pripominky jsou podnetne. Bohuzel mi vsak nebyl schvalen viceprocesorovy system na UNIXu vzhledem k neschopnosti zdejsich IT techniku, kterí by nebyly schopni podobny stroj obstarat. Vymluva - moc prace! Ja na to rovnez cas nemam, nehlede na to ze Linux je pro me velka neznama. Proto aktualizuji tento dotaz - prosim o konstruktivni rady bez omacky v techto okruzich:1) MB na P4 - stabilni, vykonny2) co za UPS (neznam ani ň)3) system musi byt WIN (!!) - jake konkretne (pozn. sw nepodporuje viceprocesorovy system ani UNIX ! )Za odpovedi dekuji - je dost mozne ze se budu ptat dal...

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

deska např: Intel Maryville, Intel850, RIMM, audiopaměť: 2x RIMM 256MB, 800MHzprocesor: Intel P4/ 2,26GHz/533 ( pokud z finančních důvodů bude možno pak 2,56GHz, ale je o 12tis. dražší )disky: Seagate Barracuda IVVGA: Matrox G550 DDR DH ( když finance dovolí, můžete zkusit Matrox Parhelia ... + 7000,- )CDRW: Plextor např. W4012TAa rozhodně výkonný zdroj - aspoň 300W

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

UPS - zde bude dáno možnostmi dodavatelesystém WINDOWS 2000 

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Co je to za software na narocne modelovanie ak nepodporuje viac procesorov???Chcelo by to aspon 4x CPU!

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

ZdravimIntelu bych se vyhnul a hned ti reknu proc. P4 je kvuli sve dlouhe pipeline dost pomaly na takovy vypocty, co potrebujes. (teda doufam, ze se nepletu). No a PIII ma zase 100 nebo 133 MHz zbernici. AMD je daleko za nim. Uz davno neplati, ze AMD je na hrani a Intel na praci. Pokud koupis nejvykonejsiho athlona XP nejlepe verzi MP a poradne ho uchladis, tak jses naprosto bez problemu. Na AMD platformu doporucuju desku abit, dualprocessor a pameti DDR 400 a trochu pridat sbernici.Pokud trvas na intelu.P4 bych se vyhnul, vem 2xPIII a na adminy se vykasli. Je naprosto suma fuk, jestli je to singleprocessor nebo dual. Doporucuju desku s integrovanou grafikou od intelu, jsou sice drazsi (pochopitelne), ale kvalita je kvalita. Vykasli se na ty magory, co ti radej kyro II a podobny blbosti, na zobrazeni windowsu NAPROSTO V POHODE a bohate staci ta integrovana, vim to moc dobre. Odhaduji tomu vykon jako ma geforce 2 MX 200. To, ze se intelacky desky moc na verejnosti neukazujou neznamena, ze to je smejd. Je to proto, ze jsou drahy a prakticky je nelze pretaktovat. Jinak je to ale sazka na jistotu.Jinak disk samozrejme SCSI a pameti tak rychle jak jen to jde. V nabidkach jsem uz videl DDR400, ale jinak jsem o tom vubec nic nikde necetl, takze nevim, jestli to do nejaky nepretaktovatelny desky nacpes a vyuzijes.Zdenek

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Zdravim, takze rozpocet byl snizen na 65 000,- coz mi teda vubec nevadi. Inspirovali jste me a nekolik mych "hw-pratel"  a zcela sem po nekolika hodinach na netu prehodnotil celou vec. Zde navrhuji sestavu o ktere se domnivam ze ji neni moc co vytknout - samozrejme vytykejte MB MicroStar K7D Master-L - AMD 760MPX, Dual, DDR (pozn. integr. LAN)  Cena bez DPH: 7 596,00 KčCena včetně DPH: 9 267,00 Kč2x CPU AMD AthlonMP 1900+ 1,60GHz/266MHz Socket A  Cena bez DPH: 5 860,00 KčCena včetně DPH: 7 149,00 Kč         včetně DPH: 14 298,00 Kč2x RAM DIMM 512MB DDR PC266 (PC2100) CL2.5Cena bez DPH: 3 834,00 KčCena včetně DPH: 4 677,00 Kč         včetně DPH:  9 354,00 KčHDD Seagate Barracuda IV ST380021A- 80GB 7200ot  Cena bez DPH: 3 476,00 KčCena včetně DPH: 4 241,00 KčVGA Matrox Millennium G450 32MB DDR Dual Head OEM  Cena bez DPH: 2 792,00 KčCena včetně DPH: 3 406,00 KčCDRW Teac CD-W540E 40x/12x/48x ATAPI OEM  Cena bez DPH: 2 265,00 KčCena včetně DPH: 2 763,00 Kč2x COOLER CoolerMaster DP5-7H53F-0L Socket A, 370  Cena bez DPH: 352,00 KčCena včetně DPH: 429,00 Kč         včetně DPH:  859,00 KčCASE Middletower ATX EuroCase 300W P4 ML 5491  Cena bez DPH: 1 082,00 KčCena včetně DPH: 1 320,00 KčMON Samsung SyncMaster 17" 757DFX  Cena bez DPH: 8 380,00 KčCena včetně DPH: 10 224,00 KčUPS APC Back-UPS CS 350EI  Cena bez DPH: 2 434,00 KčCena včetně DPH: 2 969,00 KčMyš Microsoft Intellimouse Explorer 3.0 USB OEM  Cena bez DPH: 869,00 KčCena včetně DPH: 1 060,00 Kč Cena Ukázat celý příspěvek

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

fuj to se mi to rozlezlo

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Omlouvam - sem hrozne zbrklej a zacina se na me tlacit. Nekde nahore sem psal ze aplikace nepodporuje multiprocesorovy system - tuto informaci nemam overenou. Presto sem navrhl soustavu s dualnim MB - no neda se nic delat, musim to jit zjistit.

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

No .... nechci tady nějak dělat vlny.... ale myslím si, že ten stroj by měl být spolehlivější než "server" což se mi v tvé navrhované konfiguraci nezdá .... Určitě to chce speciální serverový stroj, a jak je známo, tak servery jsou jedině Intel inside ... Zodpovědnost je to jako bejk ... asi i mně by se trošku klepali kolena při sestavování takového stroje   je to postě maximální výkon, při maximálním přetížení stroje, se 100% spolehlivostí .... Nejsem nijak velký zastánce Intelu, ale s AMD bych do toho nešel .... Představ si, až si tě někdo zavolá po deseti dnech výpočtů že se ten stroj seknul, nebo že to hodilo hlášku o neplatné operaci ...  

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

komu není rady, tomu není pomoci.

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

No vtip je ale v tom ze me nikdo volat nebude - ten kdo bude volat budu ja  Ja budu ten komp pouzivat a na starost ho bude mit uplne nekdo jinej

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Tak a babo rad ! Software nepodporuje viceprocesorovy system a ja sem tam kde sem byl. Otazkou, kterou polozim nechci v zadnem pripade provokovat k nejake flamewar, ale nic jineho mi nezbyva - amd nebo intel? U AMD ocenuji kratsi pipeline nez je u P4, ale zda-li to ma pro moje potreby tak velky vyznam si jisty nejsem. Opakuji ze je nutne postavit relativne stabilni stroj (bez restartu by mel vydrzet alespon tyden - to nepovazuji za prilis vysoky narok ). Do konce tydne musim mit navrzenou konfiguraci. Vyjadri se jeste nekdo? Za puvodni reakce diky....

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

A co takhle tu tvojí aplikaci cvičně zkusit pustit na pár strojích s různou HW konfigurací a pak se rozhodnout ...  Aspoň si budeš moci vyzkoušet na čem nejvíc záleží, nebo ještě lépe, dát aplikaci dodavateli HW, ať to udělá za tebe a naladí co nejlepší počítač. Spousta techniků by si s tím rádo pohrálo ... 

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět
 |   | 

Soft je odzkousen na pentiu 233 s ani nevim kolik RAM (hruza - jeden trivialni vypocet cca 7 hodin - svete div se ) a na mym pracovnim kompu (PIII 1GHz, 256RAM) kde stejny vypocet trva cca 20 minut. Priznavam, ze by dost mozna bohate stacil pocitac ktery mam, ovsem take bych rad kdyz uz ty prachy na to mam je utratil .Kdybych na to mel cas rad bych si pohral sam, ale ten nemam.  

Souhlasím  |  Nesouhlasím  |  Odpovědět

Související témata: Hell, Konfigurace


Určitě si přečtěte

10 věcí, které nás štvou na Windows 10 a bohužel asi jen tak nepřestanou

10 věcí, které nás štvou na Windows 10 a bohužel asi jen tak nepřestanou

** Windows 10 je na trhu 5 let, ale pořád má velké rezervy ** Ani desátá velká aktualizace, která vyjde na podzim, je nevyřeší ** Štvou nás Windows Update, Store, Nastavení atd.

Lukáš Václavík | 146

Nejlepší programy z roku 2000: Podívejte se, bez čeho jste tehdy vůbec nemohli fungovat!

Nejlepší programy z roku 2000: Podívejte se, bez čeho jste tehdy vůbec nemohli fungovat!

** Dnes už skoro všechno uděláte ve webovém prohlížeči a na mobilu ** Před dvaceti lety to ale bylo jiné ** Zavzpomínejte na legendy, které jste pravděpodobně také používali

Jakub Čížek | 129

Nvidia představila grafické karty GeForce RTX 3090, RTX 3080 a RTX 3070. Známe české ceny

Nvidia představila grafické karty GeForce RTX 3090, RTX 3080 a RTX 3070. Známe české ceny

** Nvidia uvedla nové desktopové grafické karty GeForce RTX 3000 ** Jedná se o modely GeForce RTX 3070, 3080 a 3090 ** K výrobě se používá 8nm technologii od Samsungu

Karel Javůrek | 67

Zahodil jsem Windows, přešel na Linux a nezbláznil se z toho

Zahodil jsem Windows, přešel na Linux a nezbláznil se z toho

** Měsíc jsem se nedotkl Windows a byl závislý jen na Linuxu ** Jaká byla pozitiva a negativa přechodu? ** Se kterými aplikacemi jsem (ne)zápasil a které bych doporučil?

Lukáš Václavík | 242

Porovnání deseti cloudových disků: kam a za kolik uložit 100 GB, 1 TB a 10 TB dat?

Porovnání deseti cloudových disků: kam a za kolik uložit 100 GB, 1 TB a 10 TB dat?

** Zjistili jsme, kam do cloudu nejvýhodněji uložíte data ** Vytvořili jsme žebříček cen deseti cloudových úložišť ** Ceny se liší - často i velice výrazně!

Karel Kilián | 102

Na měsíc jsem opustil Google a potupně se zase vrátil zpět (komentář)

Na měsíc jsem opustil Google a potupně se zase vrátil zpět (komentář)

** Zkusil jsem se zbavit závislosti na vyhledávači od Googlu ** Jako alternativy posloužily Bing, Seznam a DuckDuckGo ** Mají své silné stránky, ale i nepřekonatelná negativa

Lukáš Václavík | 70

WindowsFX: Nainstalujte to mamce a taťkovi. Ani nepoznají, že to je Linux

WindowsFX: Nainstalujte to mamce a taťkovi. Ani nepoznají, že to je Linux

** Po dvou měsících tu máme další linuxovou kopii ** Tentokrát jde o imitaci Desítek ** Sestavili ji brazilští geekové nad Ubuntu

Jakub Čížek | 143


Aktuální číslo časopisu Computer

Megatest mobilů do 8 000 Kč

Test bezdrátových headsetů

Linux i pro začátečníky

Jak surfovat anonymně