Ještě se zkus podívat do biosu, zda tam není položka OS INSTALATION .U asusu tam ta položka byla viz. odkaz co jsem dávál předtím. Před instalací dáš OS INSTALATION start a po instalaci to změníš na finished .Někdy taková pitomost pomůže. Přepokládám , že jsi kromě příkazu fixmbr zkoušel i příkaz fixboot.
Problém je v zavaděči. Systém máš nainstalováný a informace pro zavaděč je na flešce. Proč tomu tak je nevím.
Možná by pomohla instalace grubu ač se primárně používá pro linux, ale pořád s tím bojuji.
Zde jsou odkazy o zavaděčích. Třeba se tím prokoušeš.
Zkus odkaz http://cs.wikipedia.org/wiki/Zavad%C4%9B%C4%8D_(opera%C4%8Dn%C3%AD_syst%C3%A9m)
a
http://guidalinux.altervista.org/suselinux-manual_cs-10.1-16/sec.lilo.entfernen.html
Nevím zda ti to pomůže. Sám se tím snažím prokousat a nedaří se tak jak bych chtěl natož abych radil co nemám odzkoušené.