Ano přesně tak jsem to udělal teď doma. Před instalací jsem odpojil hlavní HDD, flashdisk na který se měl Linux nainstalovat jsem naformátoval Ext4 a poté spustil automatickou instalaci. Grub si upravím pomocí Grub customizeru a bude to doufám vyřešené a linux poběží i v práci :) .