Umí to Cmd.exe. Seznam by měl být v textovém formátu. Pro tebe asi nejsnadnější postup bude, když si příkazem dir vytvoříš textový seznam jak starých názvů, tak (třeba do jiného souboru) seznam nových názvů. Potom je sloučíš (ručně) ty soubory tak, aby každý řádek vypadal takhle nějak:
ren "starý_název" "nový_název"
takto vzniklý přejmenuj na cokoliv.cmd, přemísti do adresáře s přejmenovávanými soubory a spusť. Doporučuji, aby jsi měl, pro všechny případy, někde bokem ulité kopie těch starých souborů, kdyby se něco nepovedlo...