Záleží na spolehlivosti. Není k tomu sice asi žádný extra důvod, ale hodně lidí, co znám, se při zálohování dat na externí HDD spálilo, když jim pošel. Neznám přesnou statistiku, ale mám pocit, že kvalitní HDD má v PC větší životnost než v externím boxu.
Možná je nejlepší řešení kvalitní disk do PC, překopírovat na něj data a pak ho odpojit.