Velmi zjednodušeně:
U PDF je velmi přesně specifikované, jak se má obsah zobrazit: jak velká je stránka, kde přesně na ní je text, jakým přesně fontem (pokud vůbec je to uložené jako text - text může být převeden do obrázku), kde přesně jsou rozdělená slova na konci řádku (pokud jsou vůbec rozdělená) atd. atd. Můžeš si to představit jako potisknutý list papíru - ať se na něj bude dívat kdokoliv, vždy ho uvidí stejně.
EPUB naproti tomu obsahuje převážně text a k tomu základní instrukce typu "tady zalom odstavec" nebo "tenhle kousek chci zvýraznit". Konkrétní interpretace je na zobrazovacím zařízení.
Z toho vyplývají výhody a nevýhody: PDF se zobrazuje všem stejně, což je prima, pokud ti vyhovuje vzhled stanovený autorem. Pokud máš nějaké specifické potřeby, třeba že to PDF je dělané pro papír velikosti A4 a ty máš zobrazovací zařízení velikosti A6, tak máš docela smůlu, protože máš volbu akorát mezi třemi špatnými možnostmi (všechno zmenšit, takže to nebude čitelné, nechat původní velikost a posouvat, takže to bude nepohodlné, a nebo použít reflow, takže se to přizpůsobí tvému displeji, ale zůstane o málo víc než prostý text). EPUB má výhody a nevýhody víceméně opačné - každému se to zobrazuje jinak, ale pokud se například rozhodneš, že hůř vidíš a potřebuješ dvakrát větší písmo, tak se tomu EPUB přizpůsobí, aniž bys musel cokoliv obětovat. Obdobně když přejdeš na zařízení s jinou velikostí displeje. Dokonce bys mohl použít zařízení, které displej vůbec nemá a text převádí na řeč.
