"technicky" je uplne jedno jak to tam zastrkas.
ale z duvodu windowsu doporucuju zastrcit jeden disk do SATA0, druhy disk do SATA1 a treti disk do SATA2.
Windows jim vetsinou v tomhle poradi bude prirazovat pismenka. A bylo by celkem nezvykle mit jako C: dvd mechaniku, na D: mit system, atd.