Hodně zjednodušeně: SSHD funguje tak, že si na ssd část umisťuje data, na která systém často "sahá". Když spustíte defragmentaci, disk to trochu zmate - data, co jsou defragmentována, může disk vyhodnotit jako data, ke kterým často přistupujete. To se ale rychle vyřeší opět klasickým používáním - disk se brzy "srovná" a na SSD část si opět uloží jen to, co často používáte.