M$ formaty a specifikace jsou zamerne nekompatibilni ale ze strany M$, staci se podivat na zbastleny javascript, predelanou javu ala M$, jejich "standardni" formaty typu DOC a XLS, movie maker, ktery neuklada do mpeg2 (takze nepouzitelny), proste prikladu je spousta. M$ cokoli sam nevymysli, tak ignoruje - viz. PNG, ktere kazdy normalni prohlizec bez problemu zobrazuje uz nekolik let, ale IE s tim prichazi az ted.
Jinak sis odpovedel v prvni vete: Winďous je úmyslně nekompatibilní s ostatními systémy...