Jako výchozí systémové úložiště nadále slouží karta microSD, i když lze RPi nakonfigurovat i tak, aby startovalo třeba z externí USB jednotky. V každém případě, pořiďte si co nejrychlejší SD kartu se zápisem v řádu desítek MB/s a ještě rychlejším čtením, aby se data anhrála do RAM co nejsvižněji. V takovém případě dokáže operační systém Raspbian nastartovat zhruba do 15 sekund.