Poslední dobou je Facebook často propírán ohledně sledování uživatelů na internetu, a to i v případě, že nemají na Facebooku účet. Také z tohoto důvodu se před měsícem na Facebook snesly žaloby. A zástupci Facebooku tak musí vysvětlovat a objasňovat, viz článek deníku USA Today, ve kterém zazněla vyjádření tiskových mluvčí a vedoucích produktových manažerů Facebooku. Na rovinu popsali, jak sledování uživatelů probíhá.
Facebook sledované uživatele rozděluje na tři typy – ti kteří mají účet a jsou trvale přihlášeni, s účtem bez přihlášení a bez účtu na Facebooku. Sledování začne v okamžiku, kdy navštíví jakoukoli stránku na doméně Facebook.com a do prohlížeče se tak zavedou cookies. Poté se po dobu 90 dní (pokud znovu nenavštívíte web Facebooku) zaznamenávají vaše návštěvy na webech, kde je nějaký vložený prvek Facebooku, typicky tlačítka „To se mi líbí“ nebo „Sdílet“.
Ochrana před sledováním Facebooku: vymažte v prohlížeči cookies vždy po návštěvě stránky na doméně Facebook.com
V základu si vás Facebook identifikuje podle dostupných dat charakteristiky počítače a internetového prohlížeče, jako je IP adresa, rozlišení obrazovky či verze internetového rozlišení. Pokud jste na Facebooku registrováni a trvale přihlášeni, je k vašemu logu navštívených stránek přiřazeno i skutečné jméno, e-mail a další data z profilu, samozřejmě včetně vazeb na přátele. Facebook tak získává data o pohybu na internetu různých zájmových skupin, kdo kdy a jak používá internet a další hromady cenných statistických dat a osobních informací.
Zástupci Facebooku shodně tvrdí, že jejich systém není nijak protiprávní. Registrovaní uživatelé se způsobem záznamů souhlasí v podmínkách služby a ti neregistrovaní jsou podobně sledovaní různými reklamními a analytickými systémy, kterými je web protkán. Ovšem někteří kritici a třeba také evropští zákonodárci se proti sledovacím praktikám Facebooku staví, protože už mohou být za hranicí zákonných pravidel pro nakládání s osobními údaji.